Удалось воспроизвести подобное полностью перезагрузив свой клиент.
Фикс выгружен.
Ситуация заключалась в конфигах GregTech.
Параметр doProcessingArray был true. В новых версиях он по умолчанию false. Установил на сервере его в положение false.
Спасибо большое за сигнал